Uma pequena fração dos resíduos
de citosina do DNA contêm grupos metil ligados ao carbono 5 (5-metilcitosina).
Estes grupos são adicionados por enzimas específicas, as DNA metilases, após
a incorporação dos resíduos de citosina nas cadeias de DNA.
Resíduos de adenina também podem
ser metilados formando 6-metiladenina, por uma DNA metilase distinta.
Em procariotos, adenina metilada é
mais comum que citosina metilada. Em eucariotos, quase todos os resíduos de
citosina são metilados.
Quando as citosinas são metiladas, o
equilíbrio das três formas de DNA (A-DNA, B-DNA e Z-DNA) se desloca em favor
do Z-DNA, influenciando na função gênica.